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      AAV載體構建

      基因治療(Gene Therapy)是指將外源基因導入靶細胞,以糾正或補償因基因缺陷或基因表達異常引起的疾病。腺相關病毒(adeno-associated virus, AAV)作為基因治療的一種明星載體,對于人類攻克癌癥或更多的重大疾病有著巨大的潛力。AAV質粒中的反向末端重復序列(inverted terminal repeat,ITR)完整性對rAAV (recombinant adeno-associated virus) 的構建至關重要。缺失突變的ITRs會降低完整AAV病毒的產量,增加非目的DNA包裝的產生。

      為此,GENEWIZ開發了一套針對rAAV質粒構建、錯誤ITR的修復和rAAV質粒大量制備的方法——Hi-Fi技術,該方法的核心點不僅僅是制定了更簡單、靈活和快速的克隆方案,而更重要的是發明了一種特殊的大腸桿菌細胞及其培養條件,使rAAV質粒的ITR在細菌中的擴增過程保持穩定,不易發生缺失。


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      AAV載體構建

      技術細節

      GENEWIZ開發了一套針對rAAV質粒構建、錯誤ITR的修復和rAAV質粒大量制備的方法——Hi-Fi技術,該方法的核心點不僅僅是制定了更簡單、靈活和快速的克隆方案,而更重要的是發明了一種特殊的大腸桿菌細胞及其配套使用的AAV穩定劑,較現有的方法更能使rAAV質粒的ITR在細菌中擴增過程中保持穩定,不易再發生缺失(表1)。

       表1:5個隨機AAV構建后ITR的正確性

       感受態細胞 結果 
         Sample1 Sample2  Sample3  Sample4  Sample5 
       Sl3 0%(0/8)   0%(0/8)   n/a   100%(10/10)  91.7%(11/12) 
       Sl4 0%(0/8)   0%(0/8)   n/a 100%(10/10)  83%(10/12) 
       Sla 0%(0/8)   0%(0/8)    n/a 100%(10/10)  83%(10/12) 
       Sle 0%(0/8)   12.50% (1/8)  100% (8/8) 100% (8/8)   100% (8/8)  
       B83 0%(0/8)   0% (0/8)  100% (8/8)   87.50% (7/8)   87.50% (7/8)
       Hi-Fi  87.5% (7/8)  100% (8/8) 100% (8/8)  100% (8/8)  100% (8/8) 

      基于感受態細胞的對比數據,安升達進一步探索了Hi-Fi技術流程在轉化篩選正確克隆過程中的能力。由于ITR本身的不穩定性,在質粒構建的過程中,會有發生突變的可能性。

      原始質粒:

      原始質粒20200305-2

      第一次轉化結果:

      20200309-1

       

      目前安升達基于Hi-Fi技術可以提供rAAV的質粒構建,ITR區域的修復和rAAV質粒大量制備以及AAV病毒包裝等相關服務。

       

       

      技術流程

      20200309-2

       

      發貨標準


      AAV-ITR構建、修復:ITR區域測序并確保正確;2-5μg。

      升級服務:≥90%超螺旋;內毒素≤10EU/mg;μg-g級別的發貨量;0.22μm過濾除菌。

      AAV-ITR大抽: ITR區域測序并確保正確。

      服務優勢


      先進的合成技術:可以合成高難度重復序列,高GC含量的困難序列以及含有發夾結構的ITR區域。

      免費的表達系統優化:可以根據表達系統對目的基因進行密碼子優化。

      完善的服務流程:可以提供從基因合成,載體構建到病毒包裝的一站式服務。

      質量可靠:酶切和測序雙重檢測,安升達自主研發的ITR測序技術能夠測通ITR區域,確保序列100%正確。

      周期短:rAAV-ITR載體構建8天起。

      案例分享

      1、項目類型:Hi-Fi 技術構建 rAAV 載體

      目的基因以及ITR區域合成之后,構建AAV載體之后,再利用SmaI酶進行酶切后,驗證條帶大小。

      20200306-31

      圖5: 酶切圖,L1: undigested;L2: digested with SmaI and BsrGI;L3: ladder 5000


      條帶大小正確后,再利用sanger測序技術,測定目的基因和ITR區域序列:

      20200309-4

      圖6:ITR區域測序圖

      上圖可以看出,Sanger測序驗證了rAAV左右兩側的ITR區域序列正確。從而確保rAAV載體構建正確。

       

      2.、項目類型:Hi-Fi技術修復ITR序列

      AAV原始質粒ITR缺失突變,常規PCR擴增很難直接完成序列修復,安升達通過特定修復方案及Hi-Fi技術流程,成功交付多例修復質粒。

       

      20200309-3

      GENEWIZ_pUC57_Plasmid_Map

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