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      全長轉錄組測序

      轉錄組是細胞或組織內全部RNA轉錄本的集合,它反映著不同的生命階段、不同的組織類型、不同的生理狀態以及不同的環境條件下表達的基因。轉錄組的研究可以從整體上揭示細胞中基因的表達情況及調控規律。第二代測序技術由于讀長限制,無法提供轉錄本的全貌及可變剪接等重要信息,因而大大制約了轉錄組數據的深度利用。

      安升達引進Pacbio Sequel測序平臺,具有長讀長,可以測通完整轉錄本,無需測序后的拼接和組裝,直接讀出全長轉錄本的基因結構等信息,從而獲得可變剪接、融合基因、新轉錄本、新內含子等信息。


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      全長轉錄組測序服務的優勢

      無需拼接和組裝,直接獲取全長轉錄本
      發現新轉錄本,新的可變剪切組合
      一次性測出可變剪切、融合基因、單堿基突變等

      服務參數

       樣品要求 建庫步驟  測序策略 
      • 3-5µg高質量Total RNA
      • OD260/280>2,RIN值>9
      • 核酸濃度大于500ng/µl
      • RNA樣品 QC
      • 制備全長cDNA
      • PCR擴增
      • cDNA片段分級建庫
      • 采用Pacbio Sequel平臺,每個樣品片段長度分級構建2-4個測序文庫
      • 根據數據量要求,在一個SMRT cell上測一個火同時測多個文庫
             

      注:安升達可根據客戶對病毒量的需求,可提供病毒量109TU,滴度 ≥109TU/ml的病毒。

      RNA干擾慢病毒包裝

       服務介紹 標準交付 
      • 雙鏈RNA可以高效特異地阻斷體內特定基因表達, 促使mRNA降解,誘使細胞表現
        出特定基因缺失的表型, 稱為RNA干擾(RNA interference, RNAi).利用RNA干擾機
        制可以實現細胞中基因的敲除。
      • 安升達根據客戶提供的基因 信息和服務需求,設計該基因高效的siRNA靶點,或是
        客戶直接提供已經設計好siRNA 靶點,安升達制定符合客戶要求的方案,構建干擾
        慢病毒載體,包裝的病毒顆??捎? 于細胞實驗和動物實驗。
      • 病毒量108TU,滴度≥108TU/ml
      • 對照病毒200ul,滴度≥108TU/ml
      • 病毒QC報告(含滴度檢測和無菌檢測)
      • 凍干的病毒質粒4ug和質粒QC文件
             

      注:安升達可根據客戶的對病毒量的需求,可提供病毒量109TU,滴度 ≥109TU/ml的病毒。

      高通量測序平臺

      安升達的高通量測序平臺包括Illumina  NovaSeq,HiSeq X Ten,HiSeq,MiSeq,PacBio Sequel、10X Genomics及MGISEQ-2000。
      可提供多種測序讀長、通量和時間周期選擇,滿足各類科研及應用需求對成本和速度的差異化需求。
      如需了解不同NGS平臺的更多相關信息以及推薦平臺的規格說明,請訪問高通量測序平臺頁面。

      高通量測序_三個圖標

       

       

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