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      16S/18S/ITS測序及宏基因組測序


      16S宏基因組測序常常采用高通量擴增子測序技術來檢測微生物16S rRNA基因的特定高變區。16S MetaVx™是安升達公司獨立研發的微生物菌群高通量測序平臺,適用于環境微生物、腸道菌群等樣品的細菌和古細菌相對豐度的鑒定。16S MetaVx™體系采用多套引物同時擴增細菌和古細菌的V3、V4和V5 三個可變區,大幅提高當前16S宏基因組學技術的靈敏度和特異性。與常用的16S宏基因組學檢測方法相比,16S MetaVx™能夠檢測出更多的痕量的細菌和古細菌。

      除了細菌和古菌的高通量檢測,安升達也提供針對真菌和原生生物的菌群檢測服務,主要包括ITS測序和18S測序兩種。18S測序主要鑒定真菌及其他原生生物,適用于浮游微生物、土壤微生物等環境微生物,以及共生的真核生物菌群等。而ITS測序主要鑒定真菌,如果樣品以真菌為主,或者僅關注樣品中的真菌菌群,可以選擇ITS測序。請聯系安升達獲得關于ITS測序和18S測序的詳細信息。


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      服務選項

      • 16S MetaVx? (不含真核生物) 

        環境樣品16S MetaVx?測序,使用兩個擴增子檢測16S基因的V3、V4和V5三個可變區,其中一個擴增子分析V3/V4區,另一個擴增子分析V4/V5區。該項服務適于檢測真核生物DNA含量較低的樣品。

      • 16S MetaVx? (含真核DNA)

        哺乳動物16S MetaVx?測序,采用一個擴增子檢測16S基因的V3和V4可變區。該項服務適于檢測真核生物DNA含量較高的樣品,此擴增體系去掉了與真核18S基因同源性較高的V5區。

      服務優勢



      結果更真實:多套引物設計,同時檢測細菌和古細菌,真實反映菌群組成


      檢測區域更多:同時檢測V3、V4和V5 三個可變區,顯著提高檢測能力


      讀長更長:MiSeq(PE300)測序,大幅提高測序讀長和檢測的準確性


      數據量更大:不低于5萬 reads/樣品, 保證檢測到樣品中的痕量微生物


      方案靈活多變:多套引物和實驗方案,全面解決細菌、古菌、真菌的各類檢測需求,能檢測真核生物DNA含量較高的樣品


      周期更短:采用MiSeq測序,方便快捷,最短20個工作日交付檢測報告


      價格更實惠:流程化實驗操作,節省您的每一分科研經費

      技術細節

      相對于目前已有的宏基因組16S鑒定平臺,安升達開發的16S MetaVx?測序平臺兼具保守性和靈活性,能夠覆蓋絕大部分細菌菌群,并同時鑒定細菌和古菌。比常規的16S檢測更加靈敏,并且更能反映真實的菌群組成和結構。
      使用16S MetaVx?測序平臺和常用的16S V4區高通量測序平臺,在相同條件下,同時對相同的樣品進行擴增測序。測序完成,將數據進行歸一化。比對結果如下:

      • 圖1 16S MetaVx™ Vs 常規16S測序

        模擬測試樣品,16S MetaVx™平臺檢測出19個綱的微生物,而常規16S測序僅檢測出11個綱。*僅被16S MetaVx™平臺檢出。**占菌群80%左右,上圖未包含。

      • 圖2 增加V5區顯著提高菌種檢出率

        16S MetaVx™測序平臺增加了V5可變區檢測,能夠比單單檢測V3V4可變區在不同的物種分類層級上多鑒定出10-15%的菌種。

      安升達16S/18S/ITS測序及宏基因組測序流程

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        實驗設計


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        &文庫制備

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        高通量測序


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      • 微生物特性分析


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      安升達宏基因組學樣品提交指南

      安升達的宏基因組學項目可以針對土壤、糞便、空氣、水體、動植物體表和體內等任何來源提取的全基因組DNA進行檢測,除了已純化的基因組DNA,也可以提供土壤、糞便、液體和組織等樣品。如需獲得更詳細的樣品提交要求,請訪問我們的樣品提交指南頁面。

       

      安升達16S/18S/ITS測序及宏基因組測序服務標準交付

      ? 原始數據(FASTQ格式)     ? 項目結題報告

      高通量測序平臺

      安升達的高通量測序平臺包括Illumina  NovaSeq,HiSeq X Ten,HiSeq,MiSeq,PacBio Sequel、10X Genomics及MGISEQ-2000。
      可提供多種測序讀長、通量和時間周期選擇,滿足各類科研及應用需求對成本和速度的差異化需求。
      如需了解不同NGS平臺的更多相關信息以及推薦平臺的規格說明,請訪問高通量測序平臺頁面。

      高通量測序_三個圖標

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