16S宏基因組測序常常采用高通量擴增子測序技術來檢測微生物16S rRNA基因的特定高變區。16S MetaVx™是安升達公司獨立研發的微生物菌群高通量測序平臺,適用于環境微生物、腸道菌群等樣品的細菌和古細菌相對豐度的鑒定。16S MetaVx™體系采用多套引物同時擴增細菌和古細菌的V3、V4和V5 三個可變區,大幅提高當前16S宏基因組學技術的靈敏度和特異性。與常用的16S宏基因組學檢測方法相比,16S MetaVx™能夠檢測出更多的痕量的細菌和古細菌。
除了細菌和古菌的高通量檢測,安升達也提供針對真菌和原生生物的菌群檢測服務,主要包括ITS測序和18S測序兩種。18S測序主要鑒定真菌及其他原生生物,適用于浮游微生物、土壤微生物等環境微生物,以及共生的真核生物菌群等。而ITS測序主要鑒定真菌,如果樣品以真菌為主,或者僅關注樣品中的真菌菌群,可以選擇ITS測序。請聯系安升達獲得關于ITS測序和18S測序的詳細信息。
環境樣品16S MetaVx?測序,使用兩個擴增子檢測16S基因的V3、V4和V5三個可變區,其中一個擴增子分析V3/V4區,另一個擴增子分析V4/V5區。該項服務適于檢測真核生物DNA含量較低的樣品。
哺乳動物16S MetaVx?測序,采用一個擴增子檢測16S基因的V3和V4可變區。該項服務適于檢測真核生物DNA含量較高的樣品,此擴增體系去掉了與真核18S基因同源性較高的V5區。
相對于目前已有的宏基因組16S鑒定平臺,安升達開發的16S MetaVx?測序平臺兼具保守性和靈活性,能夠覆蓋絕大部分細菌菌群,并同時鑒定細菌和古菌。比常規的16S檢測更加靈敏,并且更能反映真實的菌群組成和結構。
使用16S MetaVx?測序平臺和常用的16S V4區高通量測序平臺,在相同條件下,同時對相同的樣品進行擴增測序。測序完成,將數據進行歸一化。比對結果如下:
模擬測試樣品,16S MetaVx™平臺檢測出19個綱的微生物,而常規16S測序僅檢測出11個綱。*僅被16S MetaVx™平臺檢出。**占菌群80%左右,上圖未包含。
16S MetaVx™測序平臺增加了V5可變區檢測,能夠比單單檢測V3V4可變區在不同的物種分類層級上多鑒定出10-15%的菌種。
安升達的宏基因組學項目可以針對土壤、糞便、空氣、水體、動植物體表和體內等任何來源提取的全基因組DNA進行檢測,除了已純化的基因組DNA,也可以提供土壤、糞便、液體和組織等樣品。如需獲得更詳細的樣品提交要求,請訪問我們的樣品提交指南頁面。
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