基因組denovo_基因組組裝_三代測序結合BioNano-金唯智

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基因組De novo測序

全基因組de novo測序(de novo sequencing)也稱為從頭測序，不需要任何基因序列信息即可對某個物種進行測序，用生物信息學的分析方法對序列進行拼接、組裝，從而獲得該物種的基因組序列圖譜。

安升達基于三代測序PacBio技術手段，對動植物基因組進行組裝和基本分析，同時結合BioNano光學圖譜，提升組裝版本，獲得高質量基因組序列，為該物種的基因組學研究奠定基礎。

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安升達基因組de novo測序服務參數

	標準服務	升級服務
技術參數	PacBio(50X)+BioNano(100X)	PacBio(70X)+BioNano(100X)
分析軟件	SMRT Link / Falcon / Canu	SuperGenome
組裝指標	Contig N50>200K，Scaffold N50>1M	Contig N50>5M，Scaffold N50>10M

安升達基因組de novo測序服務優勢

根據不同的項目需求設計不同的實驗方案

利用SuperGenome升級組裝，使Contig N50長度提升5~10倍

針對不同物種選取合適的分析軟件及流程

SuperGenome分析結果展示

將已發表的玉米、水稻及人的數據，利用SuperGenome重新組裝，在保證拼接完整性、不丟失基因組序列的前提下，Contig數目減少，Contig N50長度提升5~10倍。

SuperGenome分析結果展示

將已發表的玉米、水稻及人的數據，利用SuperGenome重新組裝，在保證拼接完整性、不丟失基因組序列的前提下，Contig數目減少，Contig N50長度提升5~10倍。

	Rice Nagia22		Maize B73		Human HX1
	Published	SuperGenome	Published	SuperGenome	Published	SuperGenome
N	912	56	2,790	706	5,915	1,454
N:n50	112	10	506	54	103	25
N:n90	450	27	1,613	190	536	122
Min	3.336	82031	1,945	28,410	2	2,502
N95	123,289	4,293,542	250,684	1,278,145	149,819	896,491
N90	197,151	5,278,830	388,549	2,379,755	576,618	2,475,108
N50	946,210	14,270,486	1,279,870	7,693,311	8,200,456	32,645,641
Max	3,538,062	31,640,606	7,264,800	44,889,389	38,177,111	108,215,793
Sum	362 Mb	385 Mb	2.1Gb	2.1Gb	2.89Gb	2.89Gb

生物信息學分析

基因組surcey

基因組組裝

基因組注釋

基因組特征評估

基因組大小預估
雜合度預估
重復序列預估
基因組預組裝

組裝結果評估

重復序列注釋

基因結構注釋

基因功能注釋

非編碼RNA注釋

高通量測序平臺

安升達的高通量測序平臺包括Illumina NovaSeq，HiSeq X Ten，HiSeq，MiSeq，PacBio Sequel、10X Genomics及MGISEQ-2000。
可提供多種測序讀長、通量和時間周期選擇，滿足各類科研及應用需求對成本和速度的差異化需求。
如需了解不同NGS平臺的更多相關信息以及推薦平臺的規格說明，請訪問高通量測序平臺頁面。

高通量測序_三個圖標

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