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      復雜結構測序

      由于二級結構、高GC含量以及其他內在因素的影響,復雜結構對于測序是巨大的挑戰。常規的測序方案往往容易出現提前中斷或者測序結果紊亂的現象。

      以下幾種序列特點的樣品適合針對復雜結構的測序方案:

      • 高GC含量:GC含量> 60%的模板,或者局部高GC含量的模板
      • 發夾結構:包含兩個反向重復序列,兩個重復序列之間間隔至少3個堿基
      • 重復序列: 2個或3個堿基的多個連續重復

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      模版示例

      小發夾RNA(shRNA)模板測序

      RNA干擾(RNAi)是指雙鏈RNA(dsRNA)介導的特異性抑制某相關基因表達的一種機制。它逐漸發展為一種研究基因功能的快速有效的新興技術。

      RNAi模板,由于其存在 “發卡結構”,給測序工作帶來了很大挑戰。在RNAi研究中采用的小發卡RNA(shRNA)通常無法測序成功,測序結果往往提前中斷或者信號紊亂。安升達擁有專門針對shRNA模板的測序方案,測序結果得到客戶的一致認可。

      從下圖您就可以看出該項技術的優越性:

      重復序列/高GC含量模板測序

      重復序列/高GC含量模板具有特殊的二級結構和解鏈溫度。包含高GC含量和發夾結構的DNA相對更難變性,對測序構成非常大的挑戰。

      安升達利用特有的技術,可以成功地對高GC含量模板以及具有其他特殊二級結構的模板進行測序。

       


      服務優勢

      先進的技術
      安升達擁有專門針對復雜模板的測序方案,測序結果得到客戶的一致認可。
      個性化方案
      安升達的技術支持團隊為您的項目需要提供個性化的科學咨詢和定制解決方案。
      優質的技術支持
      我們的技術支持會和您一起討論項目進展,解答您的疑問。周六、周日為您提供系統發送測序結果和回復緊急郵件的服務。

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