RNA干擾(RNAi)是指雙鏈RNA(dsRNA)介導的特異性抑制某相關基因表達的一種機制。它逐漸發展為一種研究基因功能的快速有效的新興技術。
RNAi模板,由于其存在 “發卡結構”,給測序工作帶來了很大挑戰。在RNAi研究中采用的小發卡RNA(shRNA)通常無法測序成功,測序結果往往提前中斷或者信號紊亂。安升達擁有專門針對shRNA模板的測序方案,測序結果得到客戶的一致認可。
從下圖您就可以看出該項技術的優越性:
重復序列/高GC含量模板具有特殊的二級結構和解鏈溫度。包含高GC含量和發夾結構的DNA相對更難變性,對測序構成非常大的挑戰。
安升達利用特有的技術,可以成功地對高GC含量模板以及具有其他特殊二級結構的模板進行測序。